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根霉也是一种常见的杂菌，常见的根霉为黑根霉(Rhizopus nigricans)。根霉菌侵染堆肥后，形成网状菌丝体，产生黑色点状分生孢子，与金针菇争夺养分，导致减产。 （一）发生条件在自然条件下，它生长于土壤、动物粪便和各种有机质中。孢子通过空气传播。 (2)防治方法一、堆肥要新鲜干燥。消毒要彻底，杀灭堆肥中的根霉孢子。二是接种时要对接种环境进行彻底消毒，防止接种工具沾上生水。三、菌种培养过程中，加强通风，保持培养室干燥。第四，发生根霉菌侵染后，将堆肥挖出，与新鲜堆肥混合杀菌再利用。
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